Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd11P23813 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd11P23813 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd11P23813 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd11P23813 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd11P23813 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd11P23813 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Gm38047-201ENSMUST00000193690 1133 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd11P23813 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd11P23813 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Gm45401-201ENSMUST00000209456 733 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd11P23813 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd11P23813 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd11P23813 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd11P23813 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Gm45832-201ENSMUST00000212762 1443 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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