Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms