Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PparaP23204 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PparaP23204 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PparaP23204 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PparaP23204 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PparaP23204 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PparaP23204 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PparaP23204 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PparaP23204 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PparaP23204 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PparaP23204 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PparaP23204 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PparaP23204 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PparaP23204 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PparaP23204 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PparaP23204 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PparaP23204 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PparaP23204 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PparaP23204 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PparaP23204 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PparaP23204 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PparaP23204 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PparaP23204 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PparaP23204 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PparaP23204 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PparaP23204 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PparaP23204 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PparaP23204 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PparaP23204 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PparaP23204 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PparaP23204 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PparaP23204 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PparaP23204 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PparaP23204 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PparaP23204 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PparaP23204 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PparaP23204 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PparaP23204 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PparaP23204 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PparaP23204 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PparaP23204 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PparaP23204 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PparaP23204 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PparaP23204 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PparaP23204 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PparaP23204 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PparaP23204 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PparaP23204 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PparaP23204 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PparaP23204 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PparaP23204 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PparaP23204 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PparaP23204 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PparaP23204 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PparaP23204 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PparaP23204 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PparaP23204 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PparaP23204 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PparaP23204 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PparaP23204 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PparaP23204 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PparaP23204 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PparaP23204 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PparaP23204 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PparaP23204 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PparaP23204 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PparaP23204 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PparaP23204 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PparaP23204 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PparaP23204 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PparaP23204 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PparaP23204 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PparaP23204 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PparaP23204 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PparaP23204 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PparaP23204 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PparaP23204 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PparaP23204 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PparaP23204 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PparaP23204 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PparaP23204 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PparaP23204 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PparaP23204 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PparaP23204 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PparaP23204 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PparaP23204 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PparaP23204 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PparaP23204 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PparaP23204 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PparaP23204 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PparaP23204 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PparaP23204 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PparaP23204 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PparaP23204 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PparaP23204 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PparaP23204 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PparaP23204 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PparaP23204 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PparaP23204 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PparaP23204 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms