Protein–RNA interactions for Protein: P22893

Zfp36, mRNA decay activator protein ZFP36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36P22893 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms