Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tap1P21958 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tap1P21958 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tap1P21958 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tap1P21958 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tap1P21958 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tap1P21958 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tap1P21958 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms