Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmnb2P21619 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmnb2P21619 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmnb2P21619 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmnb2P21619 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmnb2P21619 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmnb2P21619 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmnb2P21619 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmnb2P21619 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmnb2P21619 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmnb2P21619 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmnb2P21619 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmnb2P21619 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmnb2P21619 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmnb2P21619 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms