Protein–RNA interactions for Protein: P20863

Gdf1, Embryonic growth/differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf1P20863 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms