Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnnc1P19123 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms