Protein–RNA interactions for Protein: P16390

Kcna3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna3P16390 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kcna3P16390 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcna3P16390 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms