Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkceP16054 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkceP16054 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkceP16054 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkceP16054 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkceP16054 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkceP16054 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkceP16054 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkceP16054 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkceP16054 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkceP16054 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PrkceP16054 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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