Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Dnmt1P13864 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms