Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrgnP13609 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrgnP13609 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SrgnP13609 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrgnP13609 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SrgnP13609 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SrgnP13609 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SrgnP13609 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrgnP13609 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrgnP13609 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrgnP13609 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SrgnP13609 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrgnP13609 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrgnP13609 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrgnP13609 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms