Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd5P13379 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd5P13379 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd5P13379 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd5P13379 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd5P13379 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd5P13379 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd5P13379 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd5P13379 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd5P13379 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd5P13379 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms