Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lamp1P11438 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lamp1P11438 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lamp1P11438 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lamp1P11438 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamp1P11438 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamp1P11438 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamp1P11438 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamp1P11438 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamp1P11438 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamp1P11438 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lamp1P11438 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms