Protein–RNA interactions for Protein: P10287

Cdh3, Cadherin-3, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh3P10287 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh3P10287 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh3P10287 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh3P10287 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh3P10287 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh3P10287 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh3P10287 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh3P10287 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh3P10287 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh3P10287 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh3P10287 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh3P10287 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh3P10287 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh3P10287 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh3P10287 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh3P10287 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh3P10287 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cdh3P10287 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cdh3P10287 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdh3P10287 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms