Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl2P10148 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccl2P10148 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccl2P10148 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccl2P10148 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccl2P10148 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccl2P10148 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccl2P10148 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl2P10148 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl2P10148 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl2P10148 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms