Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms