Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms