Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Igsf6P0C6B7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms