Protein–RNA interactions for Protein: P09581

Csf1r, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1rP09581 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csf1rP09581 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csf1rP09581 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms