Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NefmP08553 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NefmP08553 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NefmP08553 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NefmP08553 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NefmP08553 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NefmP08553 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NefmP08553 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NefmP08553 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NefmP08553 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NefmP08553 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NefmP08553 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NefmP08553 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NefmP08553 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NefmP08553 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NefmP08553 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NefmP08553 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NefmP08553 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NefmP08553 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NefmP08553 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NefmP08553 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NefmP08553 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NefmP08553 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NefmP08553 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NefmP08553 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NefmP08553 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NefmP08553 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NefmP08553 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NefmP08553 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NefmP08553 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NefmP08553 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NefmP08553 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NefmP08553 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NefmP08553 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NefmP08553 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NefmP08553 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NefmP08553 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NefmP08553 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NefmP08553 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NefmP08553 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NefmP08553 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NefmP08553 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NefmP08553 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NefmP08553 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NefmP08553 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NefmP08553 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NefmP08553 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NefmP08553 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NefmP08553 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NefmP08553 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NefmP08553 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NefmP08553 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NefmP08553 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NefmP08553 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NefmP08553 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NefmP08553 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NefmP08553 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NefmP08553 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NefmP08553 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NefmP08553 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NefmP08553 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NefmP08553 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NefmP08553 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NefmP08553 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NefmP08553 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NefmP08553 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NefmP08553 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NefmP08553 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NefmP08553 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NefmP08553 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NefmP08553 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NefmP08553 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NefmP08553 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NefmP08553 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NefmP08553 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NefmP08553 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NefmP08553 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NefmP08553 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NefmP08553 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NefmP08553 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NefmP08553 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NefmP08553 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NefmP08553 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NefmP08553 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NefmP08553 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NefmP08553 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NefmP08553 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NefmP08553 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NefmP08553 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NefmP08553 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NefmP08553 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NefmP08553 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NefmP08553 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NefmP08553 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NefmP08553 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NefmP08553 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NefmP08553 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NefmP08553 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NefmP08553 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NefmP08553 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms