Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NeflP08551 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NeflP08551 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NeflP08551 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NeflP08551 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NeflP08551 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NeflP08551 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NeflP08551 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NeflP08551 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NeflP08551 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NeflP08551 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NeflP08551 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NeflP08551 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NeflP08551 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NeflP08551 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NeflP08551 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NeflP08551 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NeflP08551 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NeflP08551 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NeflP08551 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NeflP08551 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NeflP08551 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NeflP08551 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NeflP08551 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NeflP08551 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NeflP08551 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NeflP08551 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NeflP08551 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NeflP08551 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NeflP08551 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NeflP08551 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NeflP08551 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NeflP08551 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NeflP08551 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NeflP08551 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NeflP08551 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NeflP08551 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NeflP08551 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NeflP08551 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NeflP08551 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NeflP08551 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NeflP08551 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NeflP08551 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NeflP08551 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NeflP08551 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NeflP08551 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NeflP08551 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NeflP08551 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NeflP08551 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NeflP08551 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NeflP08551 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NeflP08551 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NeflP08551 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NeflP08551 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NeflP08551 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NeflP08551 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NeflP08551 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NeflP08551 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NeflP08551 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NeflP08551 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NeflP08551 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NeflP08551 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NeflP08551 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NeflP08551 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NeflP08551 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NeflP08551 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NeflP08551 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NeflP08551 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NeflP08551 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NeflP08551 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NeflP08551 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NeflP08551 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NeflP08551 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NeflP08551 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NeflP08551 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NeflP08551 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NeflP08551 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NeflP08551 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NeflP08551 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NeflP08551 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NeflP08551 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NeflP08551 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NeflP08551 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NeflP08551 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NeflP08551 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NeflP08551 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NeflP08551 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NeflP08551 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NeflP08551 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NeflP08551 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NeflP08551 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NeflP08551 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NeflP08551 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NeflP08551 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NeflP08551 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NeflP08551 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NeflP08551 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NeflP08551 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NeflP08551 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NeflP08551 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms