Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a2P08122 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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