Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr1P08046 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Egr1P08046 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Egr1P08046 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr1P08046 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr1P08046 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr1P08046 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr1P08046 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr1P08046 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr1P08046 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr1P08046 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms