Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Zfp1P08042 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms