Protein–RNA interactions for Protein: P05524

Fgf3, Fibroblast growth factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf3P05524 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf3P05524 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Fgf3P05524 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fgf3P05524 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fgf3P05524 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf3P05524 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf3P05524 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf3P05524 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf3P05524 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf3P05524 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf3P05524 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf3P05524 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf3P05524 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf3P05524 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf3P05524 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf3P05524 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf3P05524 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf3P05524 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf3P05524 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf3P05524 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf3P05524 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf3P05524 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf3P05524 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf3P05524 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf3P05524 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf3P05524 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf3P05524 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf3P05524 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf3P05524 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf3P05524 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf3P05524 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms