Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tgfb1P04202 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms