Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms