Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-Ab1P01921 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-Ab1P01921 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-Ab1P01921 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-Ab1P01921 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-Ab1P01921 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-Ab1P01921 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-Ab1P01921 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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H2-Ab1P01921 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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H2-Ab1P01921 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-Ab1P01921 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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H2-Ab1P01921 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-Ab1P01921 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-Ab1P01921 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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H2-Ab1P01921 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-Ab1P01921 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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H2-Ab1P01921 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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H2-Ab1P01921 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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H2-Ab1P01921 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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H2-Ab1P01921 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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H2-Ab1P01921 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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H2-Ab1P01921 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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H2-Ab1P01921 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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H2-Ab1P01921 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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