Protein–RNA interactions for Protein: P01869

Ighg1, Ig gamma-1 chain C region, membrane-bound form, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighg1P01869 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ighg1P01869 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighg1P01869 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms