Protein–RNA interactions for Protein: P01809

Ig heavy chain V region X24, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01809 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01809 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01809 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01809 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01809 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01809 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01809 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01809 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01809 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01809 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01809 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01809 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01809 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01809 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01809 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01809 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01809 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01809 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01809 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01809 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01809 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01809 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01809 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01809 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01809 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01809 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01809 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01809 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01809 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01809 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01809 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01809 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01809 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01809 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01809 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01809 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01809 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01809 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01809 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01809 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01809 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01809 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01809 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01809 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01809 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01809 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01809 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01809 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01809 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01809 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01809 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01809 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01809 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01809 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01809 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01809 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01809 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01809 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01809 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01809 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01809 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01809 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01809 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01809 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01809 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01809 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01809 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01809 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01809 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01809 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01809 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms