Protein–RNA interactions for Protein: P01798

Ig heavy chain V-III region E109, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01798 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01798 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01798 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01798 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01798 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01798 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01798 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01798 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01798 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01798 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01798 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01798 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01798 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01798 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01798 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01798 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01798 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01798 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01798 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01798 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01798 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01798 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01798 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01798 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01798 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01798 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01798 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01798 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01798 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01798 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01798 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01798 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01798 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01798 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01798 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01798 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01798 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01798 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01798 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01798 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01798 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01798 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01798 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01798 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01798 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01798 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01798 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01798 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01798 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01798 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01798 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01798 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01798 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01798 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01798 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01798 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01798 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01798 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01798 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01798 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01798 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01798 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01798 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01798 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01798 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01798 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01798 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01798 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01798 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01798 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01798 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01798 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01798 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01798 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01798 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01798 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01798 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01798 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01798 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01798 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01798 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01798 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01798 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01798 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01798 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01798 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01798 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01798 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01798 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01798 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01798 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01798 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01798 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01798 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01798 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01798 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01798 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01798 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01798 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01798 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms