Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01735 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01735 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01735 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01735 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01735 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01735 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01735 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01735 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01735 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01735 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01735 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01735 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01735 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
P01735 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01735 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01735 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01735 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01735 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01735 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01735 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01735 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01735 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01735 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01735 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01735 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01735 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01735 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01735 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P01735 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01735 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01735 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P01735 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01735 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01735 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01735 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01735 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01735 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01735 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01735 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01735 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01735 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01735 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01735 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01735 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01735 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01735 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01735 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01735 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01735 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01735 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01735 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01735 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01735 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01735 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P01735 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01735 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P01735 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01735 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01735 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01735 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01735 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01735 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01735 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01735 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01735 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01735 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01735 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01735 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01735 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01735 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01735 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01735 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01735 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01735 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01735 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01735 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01735 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01735 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01735 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01735 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01735 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01735 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P01735 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01735 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01735 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01735 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01735 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01735 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01735 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01735 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01735 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01735 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01735 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01735 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01735 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01735 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01735 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01735 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01735 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms