Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01638 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01638 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01638 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01638 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01638 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01638 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01638 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01638 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01638 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01638 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01638 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01638 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01638 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01638 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01638 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01638 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01638 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01638 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01638 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01638 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01638 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01638 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01638 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01638 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01638 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01638 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01638 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01638 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01638 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01638 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01638 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01638 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01638 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01638 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01638 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01638 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01638 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01638 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01638 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01638 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01638 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01638 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01638 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01638 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01638 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01638 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01638 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01638 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01638 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01638 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01638 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01638 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01638 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01638 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01638 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01638 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01638 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01638 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01638 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01638 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01638 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01638 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01638 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01638 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01638 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01638 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01638 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01638 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01638 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01638 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01638 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01638 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01638 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01638 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01638 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01638 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01638 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01638 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01638 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01638 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01638 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01638 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01638 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01638 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01638 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01638 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01638 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01638 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01638 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01638 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01638 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01638 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01638 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01638 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01638 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01638 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01638 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01638 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01638 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms