Protein–RNA interactions for Protein: P01193

Pomc, Pro-opiomelanocortin, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PomcP01193 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PomcP01193 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PomcP01193 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PomcP01193 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PomcP01193 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PomcP01193 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PomcP01193 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PomcP01193 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PomcP01193 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PomcP01193 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PomcP01193 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PomcP01193 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PomcP01193 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PomcP01193 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PomcP01193 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PomcP01193 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PomcP01193 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PomcP01193 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PomcP01193 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PomcP01193 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PomcP01193 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PomcP01193 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PomcP01193 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PomcP01193 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PomcP01193 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PomcP01193 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PomcP01193 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PomcP01193 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PomcP01193 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PomcP01193 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PomcP01193 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PomcP01193 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PomcP01193 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PomcP01193 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PomcP01193 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PomcP01193 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PomcP01193 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PomcP01193 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PomcP01193 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PomcP01193 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PomcP01193 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PomcP01193 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PomcP01193 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PomcP01193 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PomcP01193 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PomcP01193 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PomcP01193 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PomcP01193 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PomcP01193 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PomcP01193 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PomcP01193 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PomcP01193 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PomcP01193 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PomcP01193 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PomcP01193 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PomcP01193 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PomcP01193 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PomcP01193 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PomcP01193 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PomcP01193 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PomcP01193 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PomcP01193 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PomcP01193 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PomcP01193 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PomcP01193 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PomcP01193 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PomcP01193 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PomcP01193 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PomcP01193 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PomcP01193 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PomcP01193 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PomcP01193 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PomcP01193 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PomcP01193 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PomcP01193 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PomcP01193 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PomcP01193 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PomcP01193 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PomcP01193 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PomcP01193 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PomcP01193 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PomcP01193 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PomcP01193 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PomcP01193 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PomcP01193 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PomcP01193 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PomcP01193 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PomcP01193 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PomcP01193 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PomcP01193 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PomcP01193 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PomcP01193 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PomcP01193 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PomcP01193 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PomcP01193 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PomcP01193 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PomcP01193 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PomcP01193 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PomcP01193 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PomcP01193 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms