Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Robo1O89026 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Robo1O89026 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Robo1O89026 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Robo1O89026 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Robo1O89026 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Robo1O89026 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Robo1O89026 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Robo1O89026 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Robo1O89026 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Robo1O89026 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Robo1O89026 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Robo1O89026 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Robo1O89026 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Robo1O89026 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Robo1O89026 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Robo1O89026 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Robo1O89026 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Robo1O89026 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Robo1O89026 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Robo1O89026 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Robo1O89026 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Robo1O89026 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Robo1O89026 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Robo1O89026 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms