Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms