Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BlmO88700 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BlmO88700 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BlmO88700 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BlmO88700 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
BlmO88700 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
BlmO88700 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
BlmO88700 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BlmO88700 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BlmO88700 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BlmO88700 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BlmO88700 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BlmO88700 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BlmO88700 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
BlmO88700 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
BlmO88700 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
BlmO88700 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
BlmO88700 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
BlmO88700 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BlmO88700 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BlmO88700 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BlmO88700 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BlmO88700 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BlmO88700 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BlmO88700 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BlmO88700 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BlmO88700 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BlmO88700 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BlmO88700 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BlmO88700 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BlmO88700 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BlmO88700 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BlmO88700 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BlmO88700 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BlmO88700 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BlmO88700 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BlmO88700 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BlmO88700 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BlmO88700 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BlmO88700 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BlmO88700 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BlmO88700 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BlmO88700 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BlmO88700 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BlmO88700 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BlmO88700 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BlmO88700 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BlmO88700 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BlmO88700 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BlmO88700 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BlmO88700 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BlmO88700 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BlmO88700 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BlmO88700 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BlmO88700 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BlmO88700 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BlmO88700 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BlmO88700 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BlmO88700 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BlmO88700 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
BlmO88700 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BlmO88700 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BlmO88700 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BlmO88700 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BlmO88700 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BlmO88700 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BlmO88700 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BlmO88700 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BlmO88700 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BlmO88700 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BlmO88700 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BlmO88700 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BlmO88700 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BlmO88700 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BlmO88700 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BlmO88700 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BlmO88700 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BlmO88700 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BlmO88700 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BlmO88700 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BlmO88700 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BlmO88700 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BlmO88700 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BlmO88700 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BlmO88700 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BlmO88700 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BlmO88700 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BlmO88700 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
BlmO88700 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BlmO88700 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BlmO88700 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BlmO88700 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BlmO88700 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
BlmO88700 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
BlmO88700 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
BlmO88700 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BlmO88700 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BlmO88700 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BlmO88700 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BlmO88700 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms