Protein–RNA interactions for Protein: O88609

Lmx1b, LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1bO88609 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmx1bO88609 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms