Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops6O88545 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops6O88545 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops6O88545 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cops6O88545 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cops6O88545 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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