Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nid2O88322 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nid2O88322 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nid2O88322 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nid2O88322 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nid2O88322 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nid2O88322 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nid2O88322 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nid2O88322 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nid2O88322 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms