Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms