Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd46O88174 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd46O88174 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd46O88174 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd46O88174 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd46O88174 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd46O88174 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd46O88174 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd46O88174 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd46O88174 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd46O88174 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms