Protein–RNA interactions for Protein: O70546

Kdm6a, Lysine-specific demethylase 6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6aO70546 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm6aO70546 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms