Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vamp4O70480 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms