Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtssO70370 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CtssO70370 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CtssO70370 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CtssO70370 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CtssO70370 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CtssO70370 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtssO70370 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtssO70370 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtssO70370 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CtssO70370 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtssO70370 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtssO70370 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtssO70370 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtssO70370 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtssO70370 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtssO70370 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtssO70370 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtssO70370 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtssO70370 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtssO70370 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtssO70370 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CtssO70370 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtssO70370 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtssO70370 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtssO70370 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtssO70370 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtssO70370 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtssO70370 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtssO70370 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtssO70370 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtssO70370 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtssO70370 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtssO70370 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtssO70370 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtssO70370 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtssO70370 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtssO70370 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtssO70370 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtssO70370 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtssO70370 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtssO70370 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtssO70370 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtssO70370 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtssO70370 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtssO70370 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtssO70370 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtssO70370 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtssO70370 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtssO70370 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CtssO70370 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtssO70370 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtssO70370 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtssO70370 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtssO70370 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtssO70370 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtssO70370 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtssO70370 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtssO70370 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtssO70370 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CtssO70370 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtssO70370 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CtssO70370 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CtssO70370 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtssO70370 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtssO70370 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtssO70370 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtssO70370 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtssO70370 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtssO70370 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtssO70370 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtssO70370 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtssO70370 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtssO70370 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtssO70370 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtssO70370 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtssO70370 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CtssO70370 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtssO70370 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CtssO70370 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtssO70370 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtssO70370 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtssO70370 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtssO70370 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CtssO70370 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtssO70370 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtssO70370 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtssO70370 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtssO70370 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtssO70370 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtssO70370 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtssO70370 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtssO70370 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtssO70370 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtssO70370 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtssO70370 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtssO70370 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtssO70370 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtssO70370 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtssO70370 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms