Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lnx1O70263 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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