Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgceO70258 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgceO70258 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgceO70258 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgceO70258 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgceO70258 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgceO70258 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgceO70258 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgceO70258 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgceO70258 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgceO70258 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgceO70258 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgceO70258 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgceO70258 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgceO70258 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgceO70258 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgceO70258 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgceO70258 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgceO70258 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgceO70258 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgceO70258 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgceO70258 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgceO70258 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgceO70258 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SgceO70258 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SgceO70258 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgceO70258 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgceO70258 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgceO70258 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgceO70258 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgceO70258 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgceO70258 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgceO70258 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgceO70258 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgceO70258 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgceO70258 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgceO70258 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgceO70258 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgceO70258 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgceO70258 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgceO70258 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgceO70258 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgceO70258 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SgceO70258 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgceO70258 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgceO70258 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgceO70258 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgceO70258 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgceO70258 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgceO70258 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgceO70258 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgceO70258 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgceO70258 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgceO70258 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgceO70258 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgceO70258 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgceO70258 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgceO70258 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgceO70258 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgceO70258 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgceO70258 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgceO70258 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgceO70258 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgceO70258 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SgceO70258 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgceO70258 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SgceO70258 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgceO70258 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgceO70258 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SgceO70258 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgceO70258 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgceO70258 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgceO70258 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgceO70258 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgceO70258 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgceO70258 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgceO70258 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgceO70258 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgceO70258 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgceO70258 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgceO70258 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgceO70258 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SgceO70258 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SgceO70258 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SgceO70258 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SgceO70258 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgceO70258 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgceO70258 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgceO70258 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgceO70258 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgceO70258 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgceO70258 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SgceO70258 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgceO70258 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgceO70258 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SgceO70258 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgceO70258 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgceO70258 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgceO70258 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgceO70258 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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