Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Foxq1O70220 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Foxq1O70220 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Foxq1O70220 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxq1O70220 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxq1O70220 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxq1O70220 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxq1O70220 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxq1O70220 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxq1O70220 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxq1O70220 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxq1O70220 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxq1O70220 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxq1O70220 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxq1O70220 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxq1O70220 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxq1O70220 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxq1O70220 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxq1O70220 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxq1O70220 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxq1O70220 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxq1O70220 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxq1O70220 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxq1O70220 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxq1O70220 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxq1O70220 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxq1O70220 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxq1O70220 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxq1O70220 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxq1O70220 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxq1O70220 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxq1O70220 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxq1O70220 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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