Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChadO55226 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChadO55226 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChadO55226 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChadO55226 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChadO55226 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChadO55226 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChadO55226 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChadO55226 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChadO55226 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChadO55226 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ChadO55226 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChadO55226 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChadO55226 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChadO55226 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChadO55226 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChadO55226 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChadO55226 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ChadO55226 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChadO55226 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChadO55226 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChadO55226 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChadO55226 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChadO55226 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChadO55226 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChadO55226 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ChadO55226 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChadO55226 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChadO55226 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChadO55226 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ChadO55226 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChadO55226 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChadO55226 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ChadO55226 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChadO55226 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ChadO55226 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ChadO55226 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChadO55226 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChadO55226 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChadO55226 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ChadO55226 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChadO55226 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChadO55226 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChadO55226 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChadO55226 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChadO55226 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChadO55226 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChadO55226 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChadO55226 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChadO55226 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChadO55226 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChadO55226 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChadO55226 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChadO55226 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChadO55226 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChadO55226 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChadO55226 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChadO55226 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChadO55226 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChadO55226 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChadO55226 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChadO55226 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChadO55226 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChadO55226 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChadO55226 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChadO55226 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChadO55226 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChadO55226 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChadO55226 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ChadO55226 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChadO55226 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChadO55226 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChadO55226 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChadO55226 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ChadO55226 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChadO55226 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChadO55226 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChadO55226 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChadO55226 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ChadO55226 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChadO55226 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChadO55226 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ChadO55226 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChadO55226 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChadO55226 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChadO55226 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChadO55226 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChadO55226 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ChadO55226 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChadO55226 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChadO55226 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChadO55226 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChadO55226 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChadO55226 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChadO55226 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChadO55226 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChadO55226 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChadO55226 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChadO55226 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChadO55226 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms